Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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