Protein–RNA interactions for Protein: Q13573

SNW1, SNW domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNW1Q13573 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNW1Q13573 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNW1Q13573 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNW1Q13573 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNW1Q13573 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNW1Q13573 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNW1Q13573 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNW1Q13573 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNW1Q13573 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNW1Q13573 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNW1Q13573 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNW1Q13573 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNW1Q13573 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNW1Q13573 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNW1Q13573 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNW1Q13573 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNW1Q13573 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNW1Q13573 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNW1Q13573 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNW1Q13573 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNW1Q13573 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNW1Q13573 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNW1Q13573 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNW1Q13573 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SNW1Q13573 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SNW1Q13573 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
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