Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms