Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms