Protein–RNA interactions for Protein: Q13433

SLC39A6, Zinc transporter ZIP6, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A6Q13433 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC39A6Q13433 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC39A6Q13433 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC39A6Q13433 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC39A6Q13433 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC39A6Q13433 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC39A6Q13433 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC39A6Q13433 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC39A6Q13433 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC39A6Q13433 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms