Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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