Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
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