Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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