Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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