Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
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TRIM32Q13049 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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TRIM32Q13049 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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TRIM32Q13049 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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TRIM32Q13049 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
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TRIM32Q13049 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM32Q13049 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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