Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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