Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
STX4Q12846 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
STX4Q12846 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
STX4Q12846 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
STX4Q12846 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
STX4Q12846 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
STX4Q12846 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
STX4Q12846 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
STX4Q12846 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
STX4Q12846 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
STX4Q12846 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
STX4Q12846 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
STX4Q12846 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
STX4Q12846 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
STX4Q12846 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
STX4Q12846 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
STX4Q12846 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
STX4Q12846 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
STX4Q12846 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
STX4Q12846 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
STX4Q12846 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
STX4Q12846 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
STX4Q12846 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
STX4Q12846 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
STX4Q12846 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
STX4Q12846 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
STX4Q12846 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
STX4Q12846 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
STX4Q12846 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
STX4Q12846 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
STX4Q12846 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
STX4Q12846 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
STX4Q12846 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
STX4Q12846 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
STX4Q12846 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
STX4Q12846 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
STX4Q12846 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
STX4Q12846 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
STX4Q12846 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
STX4Q12846 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
STX4Q12846 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
STX4Q12846 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
STX4Q12846 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
STX4Q12846 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
STX4Q12846 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
STX4Q12846 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
STX4Q12846 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
STX4Q12846 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
STX4Q12846 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
STX4Q12846 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
STX4Q12846 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
STX4Q12846 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
STX4Q12846 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
STX4Q12846 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
STX4Q12846 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
STX4Q12846 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
STX4Q12846 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
STX4Q12846 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
STX4Q12846 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
STX4Q12846 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
STX4Q12846 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
STX4Q12846 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
STX4Q12846 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
STX4Q12846 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
STX4Q12846 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
STX4Q12846 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
STX4Q12846 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
STX4Q12846 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
STX4Q12846 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
STX4Q12846 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
STX4Q12846 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
STX4Q12846 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
STX4Q12846 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
STX4Q12846 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
STX4Q12846 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
STX4Q12846 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
STX4Q12846 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
STX4Q12846 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
STX4Q12846 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
STX4Q12846 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
STX4Q12846 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
STX4Q12846 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
STX4Q12846 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
STX4Q12846 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
STX4Q12846 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
STX4Q12846 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
STX4Q12846 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
STX4Q12846 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
STX4Q12846 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
STX4Q12846 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
STX4Q12846 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
STX4Q12846 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
STX4Q12846 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
STX4Q12846 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
STX4Q12846 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
STX4Q12846 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
STX4Q12846 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
STX4Q12846 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
STX4Q12846 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
STX4Q12846 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms