Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TROQ12816 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TROQ12816 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TROQ12816 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TROQ12816 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TROQ12816 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TROQ12816 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TROQ12816 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TROQ12816 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TROQ12816 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TROQ12816 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TROQ12816 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TROQ12816 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TROQ12816 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TROQ12816 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TROQ12816 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TROQ12816 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TROQ12816 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TROQ12816 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TROQ12816 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TROQ12816 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TROQ12816 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TROQ12816 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TROQ12816 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TROQ12816 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TROQ12816 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TROQ12816 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TROQ12816 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TROQ12816 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TROQ12816 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TROQ12816 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TROQ12816 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TROQ12816 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TROQ12816 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TROQ12816 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TROQ12816 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TROQ12816 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TROQ12816 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TROQ12816 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TROQ12816 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TROQ12816 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TROQ12816 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TROQ12816 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TROQ12816 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TROQ12816 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TROQ12816 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TROQ12816 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TROQ12816 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TROQ12816 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TROQ12816 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TROQ12816 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TROQ12816 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TROQ12816 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TROQ12816 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TROQ12816 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TROQ12816 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TROQ12816 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TROQ12816 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TROQ12816 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TROQ12816 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TROQ12816 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TROQ12816 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TROQ12816 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TROQ12816 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TROQ12816 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TROQ12816 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TROQ12816 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TROQ12816 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TROQ12816 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TROQ12816 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TROQ12816 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TROQ12816 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
TROQ12816 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TROQ12816 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TROQ12816 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TROQ12816 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TROQ12816 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TROQ12816 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TROQ12816 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TROQ12816 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TROQ12816 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TROQ12816 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TROQ12816 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TROQ12816 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TROQ12816 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TROQ12816 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TROQ12816 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TROQ12816 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TROQ12816 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TROQ12816 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TROQ12816 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TROQ12816 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TROQ12816 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TROQ12816 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TROQ12816 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TROQ12816 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TROQ12816 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TROQ12816 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TROQ12816 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TROQ12816 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
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