Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
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FOXO1Q12778 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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FOXO1Q12778 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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FOXO1Q12778 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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FOXO1Q12778 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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FOXO1Q12778 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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FOXO1Q12778 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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FOXO1Q12778 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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FOXO1Q12778 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
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