Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCAPQ12770 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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