Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms