Protein–RNA interactions for Protein: Q06418

TYRO3, Tyrosine-protein kinase receptor TYRO3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYRO3Q06418 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TYRO3Q06418 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms