Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms