Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms