Protein–RNA interactions for Protein: Q03923

ZNF85, Zinc finger protein 85, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF85Q03923 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms