Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms