Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms