Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms