Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms