Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACTBP60709 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACTBP60709 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACTBP60709 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACTBP60709 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACTBP60709 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACTBP60709 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ACTBP60709 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACTBP60709 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACTBP60709 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACTBP60709 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACTBP60709 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACTBP60709 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACTBP60709 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACTBP60709 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACTBP60709 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACTBP60709 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACTBP60709 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACTBP60709 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACTBP60709 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ACTBP60709 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ACTBP60709 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACTBP60709 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACTBP60709 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACTBP60709 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACTBP60709 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACTBP60709 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACTBP60709 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACTBP60709 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACTBP60709 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACTBP60709 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACTBP60709 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACTBP60709 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACTBP60709 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACTBP60709 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACTBP60709 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACTBP60709 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACTBP60709 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACTBP60709 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACTBP60709 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACTBP60709 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACTBP60709 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACTBP60709 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACTBP60709 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACTBP60709 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACTBP60709 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACTBP60709 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ACTBP60709 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACTBP60709 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACTBP60709 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACTBP60709 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACTBP60709 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACTBP60709 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACTBP60709 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACTBP60709 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACTBP60709 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACTBP60709 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACTBP60709 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACTBP60709 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACTBP60709 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACTBP60709 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACTBP60709 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACTBP60709 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACTBP60709 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACTBP60709 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACTBP60709 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACTBP60709 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACTBP60709 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACTBP60709 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACTBP60709 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACTBP60709 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ACTBP60709 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACTBP60709 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACTBP60709 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACTBP60709 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACTBP60709 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACTBP60709 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ACTBP60709 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACTBP60709 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ACTBP60709 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACTBP60709 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ACTBP60709 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ACTBP60709 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACTBP60709 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACTBP60709 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACTBP60709 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACTBP60709 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACTBP60709 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACTBP60709 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACTBP60709 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACTBP60709 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACTBP60709 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACTBP60709 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACTBP60709 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACTBP60709 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACTBP60709 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACTBP60709 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACTBP60709 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACTBP60709 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACTBP60709 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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