Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms