Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NME5P56597 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME5P56597 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME5P56597 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NME5P56597 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME5P56597 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME5P56597 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME5P56597 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME5P56597 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NME5P56597 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME5P56597 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME5P56597 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME5P56597 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME5P56597 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME5P56597 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME5P56597 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME5P56597 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NME5P56597 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME5P56597 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME5P56597 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME5P56597 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME5P56597 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME5P56597 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME5P56597 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME5P56597 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME5P56597 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME5P56597 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME5P56597 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME5P56597 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME5P56597 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME5P56597 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME5P56597 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME5P56597 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME5P56597 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME5P56597 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME5P56597 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME5P56597 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME5P56597 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME5P56597 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME5P56597 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NME5P56597 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NME5P56597 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NME5P56597 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NME5P56597 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME5P56597 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NME5P56597 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME5P56597 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NME5P56597 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NME5P56597 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME5P56597 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME5P56597 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME5P56597 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME5P56597 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME5P56597 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME5P56597 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME5P56597 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME5P56597 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME5P56597 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME5P56597 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME5P56597 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME5P56597 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME5P56597 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME5P56597 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME5P56597 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME5P56597 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME5P56597 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME5P56597 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME5P56597 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME5P56597 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME5P56597 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME5P56597 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME5P56597 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME5P56597 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NME5P56597 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME5P56597 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME5P56597 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME5P56597 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME5P56597 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME5P56597 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME5P56597 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME5P56597 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME5P56597 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME5P56597 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME5P56597 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME5P56597 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME5P56597 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME5P56597 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME5P56597 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME5P56597 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME5P56597 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME5P56597 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME5P56597 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME5P56597 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME5P56597 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME5P56597 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME5P56597 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME5P56597 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME5P56597 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME5P56597 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME5P56597 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms