Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms