Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPAP53621 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPAP53621 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPAP53621 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPAP53621 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPAP53621 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPAP53621 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPAP53621 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPAP53621 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
COPAP53621 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPAP53621 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPAP53621 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPAP53621 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPAP53621 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPAP53621 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPAP53621 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPAP53621 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPAP53621 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPAP53621 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPAP53621 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPAP53621 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPAP53621 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPAP53621 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPAP53621 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPAP53621 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPAP53621 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPAP53621 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPAP53621 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPAP53621 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPAP53621 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPAP53621 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPAP53621 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPAP53621 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPAP53621 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPAP53621 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPAP53621 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPAP53621 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPAP53621 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPAP53621 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPAP53621 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPAP53621 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPAP53621 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPAP53621 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPAP53621 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPAP53621 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPAP53621 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPAP53621 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPAP53621 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPAP53621 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPAP53621 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPAP53621 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPAP53621 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPAP53621 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPAP53621 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPAP53621 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPAP53621 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPAP53621 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
COPAP53621 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPAP53621 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPAP53621 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPAP53621 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
COPAP53621 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPAP53621 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPAP53621 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPAP53621 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPAP53621 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPAP53621 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPAP53621 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPAP53621 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPAP53621 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPAP53621 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPAP53621 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPAP53621 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
COPAP53621 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
COPAP53621 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
COPAP53621 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPAP53621 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPAP53621 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPAP53621 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPAP53621 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPAP53621 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPAP53621 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPAP53621 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPAP53621 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPAP53621 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPAP53621 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPAP53621 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPAP53621 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPAP53621 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPAP53621 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPAP53621 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPAP53621 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPAP53621 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPAP53621 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPAP53621 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPAP53621 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPAP53621 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPAP53621 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPAP53621 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPAP53621 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms