Protein–RNA interactions for Protein: P51787

KCNQ1, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1P51787 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1P51787 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms