Protein–RNA interactions for Protein: P50135

HNMT, Histamine N-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNMTP50135 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HNMTP50135 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HNMTP50135 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HNMTP50135 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HNMTP50135 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HNMTP50135 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HNMTP50135 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HNMTP50135 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HNMTP50135 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HNMTP50135 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HNMTP50135 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HNMTP50135 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HNMTP50135 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HNMTP50135 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HNMTP50135 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HNMTP50135 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HNMTP50135 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HNMTP50135 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HNMTP50135 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HNMTP50135 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HNMTP50135 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HNMTP50135 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HNMTP50135 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HNMTP50135 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HNMTP50135 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HNMTP50135 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HNMTP50135 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HNMTP50135 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HNMTP50135 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HNMTP50135 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HNMTP50135 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HNMTP50135 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HNMTP50135 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HNMTP50135 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HNMTP50135 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HNMTP50135 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HNMTP50135 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HNMTP50135 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HNMTP50135 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HNMTP50135 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HNMTP50135 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HNMTP50135 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HNMTP50135 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HNMTP50135 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HNMTP50135 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HNMTP50135 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HNMTP50135 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNMTP50135 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNMTP50135 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNMTP50135 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNMTP50135 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNMTP50135 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNMTP50135 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNMTP50135 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNMTP50135 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNMTP50135 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNMTP50135 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNMTP50135 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNMTP50135 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNMTP50135 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNMTP50135 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNMTP50135 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNMTP50135 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNMTP50135 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNMTP50135 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNMTP50135 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNMTP50135 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNMTP50135 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNMTP50135 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HNMTP50135 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNMTP50135 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNMTP50135 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNMTP50135 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HNMTP50135 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNMTP50135 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNMTP50135 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNMTP50135 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNMTP50135 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNMTP50135 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNMTP50135 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNMTP50135 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNMTP50135 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNMTP50135 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNMTP50135 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNMTP50135 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNMTP50135 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNMTP50135 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNMTP50135 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNMTP50135 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNMTP50135 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HNMTP50135 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNMTP50135 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HNMTP50135 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HNMTP50135 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HNMTP50135 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HNMTP50135 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HNMTP50135 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HNMTP50135 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HNMTP50135 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HNMTP50135 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms