Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms