Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms