Protein–RNA interactions for Protein: P45379

TNNT2, Troponin T, cardiac muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT2P45379 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms