Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms