Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTX2P32243 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTX2P32243 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTX2P32243 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
OTX2P32243 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
OTX2P32243 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
OTX2P32243 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTX2P32243 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTX2P32243 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTX2P32243 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTX2P32243 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTX2P32243 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTX2P32243 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTX2P32243 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTX2P32243 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTX2P32243 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTX2P32243 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTX2P32243 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTX2P32243 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTX2P32243 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
OTX2P32243 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTX2P32243 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTX2P32243 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTX2P32243 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTX2P32243 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTX2P32243 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTX2P32243 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTX2P32243 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTX2P32243 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTX2P32243 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTX2P32243 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTX2P32243 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTX2P32243 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTX2P32243 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTX2P32243 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTX2P32243 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTX2P32243 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTX2P32243 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTX2P32243 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTX2P32243 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTX2P32243 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTX2P32243 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTX2P32243 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTX2P32243 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTX2P32243 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTX2P32243 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTX2P32243 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTX2P32243 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTX2P32243 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTX2P32243 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTX2P32243 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTX2P32243 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTX2P32243 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTX2P32243 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTX2P32243 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTX2P32243 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTX2P32243 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
OTX2P32243 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTX2P32243 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTX2P32243 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTX2P32243 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTX2P32243 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTX2P32243 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTX2P32243 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTX2P32243 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
OTX2P32243 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTX2P32243 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTX2P32243 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTX2P32243 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTX2P32243 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTX2P32243 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTX2P32243 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTX2P32243 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTX2P32243 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTX2P32243 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTX2P32243 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTX2P32243 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTX2P32243 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTX2P32243 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTX2P32243 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTX2P32243 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTX2P32243 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTX2P32243 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTX2P32243 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTX2P32243 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTX2P32243 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTX2P32243 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTX2P32243 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTX2P32243 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTX2P32243 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTX2P32243 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTX2P32243 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTX2P32243 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTX2P32243 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTX2P32243 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
OTX2P32243 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTX2P32243 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTX2P32243 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTX2P32243 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTX2P32243 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms