Protein–RNA interactions for Protein: P31350

RRM2, Ribonucleoside-diphosphate reductase subunit M2, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRM2P31350 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RRM2P31350 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RRM2P31350 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RRM2P31350 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RRM2P31350 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RRM2P31350 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RRM2P31350 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RRM2P31350 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RRM2P31350 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RRM2P31350 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RRM2P31350 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RRM2P31350 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RRM2P31350 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RRM2P31350 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RRM2P31350 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RRM2P31350 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RRM2P31350 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RRM2P31350 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RRM2P31350 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RRM2P31350 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RRM2P31350 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RRM2P31350 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RRM2P31350 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RRM2P31350 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RRM2P31350 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RRM2P31350 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RRM2P31350 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RRM2P31350 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RRM2P31350 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RRM2P31350 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RRM2P31350 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RRM2P31350 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RRM2P31350 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RRM2P31350 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RRM2P31350 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RRM2P31350 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RRM2P31350 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RRM2P31350 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RRM2P31350 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RRM2P31350 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RRM2P31350 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RRM2P31350 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RRM2P31350 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RRM2P31350 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RRM2P31350 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RRM2P31350 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RRM2P31350 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RRM2P31350 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RRM2P31350 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RRM2P31350 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RRM2P31350 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RRM2P31350 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RRM2P31350 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RRM2P31350 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RRM2P31350 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RRM2P31350 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RRM2P31350 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RRM2P31350 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RRM2P31350 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RRM2P31350 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RRM2P31350 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RRM2P31350 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RRM2P31350 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RRM2P31350 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RRM2P31350 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RRM2P31350 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RRM2P31350 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RRM2P31350 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RRM2P31350 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RRM2P31350 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RRM2P31350 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RRM2P31350 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RRM2P31350 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RRM2P31350 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RRM2P31350 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RRM2P31350 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RRM2P31350 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RRM2P31350 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RRM2P31350 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RRM2P31350 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RRM2P31350 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RRM2P31350 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RRM2P31350 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RRM2P31350 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RRM2P31350 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RRM2P31350 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RRM2P31350 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RRM2P31350 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RRM2P31350 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RRM2P31350 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RRM2P31350 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RRM2P31350 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RRM2P31350 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RRM2P31350 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RRM2P31350 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RRM2P31350 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RRM2P31350 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RRM2P31350 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RRM2P31350 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RRM2P31350 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms