Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TSPOP30536 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TSPOP30536 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TSPOP30536 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TSPOP30536 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TSPOP30536 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TSPOP30536 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TSPOP30536 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TSPOP30536 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TSPOP30536 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TSPOP30536 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TSPOP30536 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TSPOP30536 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TSPOP30536 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TSPOP30536 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TSPOP30536 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TSPOP30536 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
TSPOP30536 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
TSPOP30536 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TSPOP30536 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TSPOP30536 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
TSPOP30536 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TSPOP30536 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TSPOP30536 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TSPOP30536 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TSPOP30536 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TSPOP30536 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
TSPOP30536 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TSPOP30536 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
TSPOP30536 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TSPOP30536 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TSPOP30536 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TSPOP30536 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TSPOP30536 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TSPOP30536 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TSPOP30536 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TSPOP30536 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TSPOP30536 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TSPOP30536 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TSPOP30536 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TSPOP30536 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TSPOP30536 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TSPOP30536 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TSPOP30536 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TSPOP30536 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TSPOP30536 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TSPOP30536 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TSPOP30536 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TSPOP30536 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TSPOP30536 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TSPOP30536 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TSPOP30536 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TSPOP30536 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TSPOP30536 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TSPOP30536 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TSPOP30536 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TSPOP30536 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
TSPOP30536 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TSPOP30536 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TSPOP30536 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TSPOP30536 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
TSPOP30536 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TSPOP30536 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TSPOP30536 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TSPOP30536 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TSPOP30536 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TSPOP30536 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TSPOP30536 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TSPOP30536 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
TSPOP30536 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TSPOP30536 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TSPOP30536 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
TSPOP30536 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TSPOP30536 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TSPOP30536 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TSPOP30536 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TSPOP30536 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
TSPOP30536 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
TSPOP30536 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TSPOP30536 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
TSPOP30536 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TSPOP30536 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TSPOP30536 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TSPOP30536 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
TSPOP30536 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TSPOP30536 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TSPOP30536 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TSPOP30536 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TSPOP30536 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TSPOP30536 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TSPOP30536 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TSPOP30536 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TSPOP30536 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TSPOP30536 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TSPOP30536 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TSPOP30536 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TSPOP30536 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TSPOP30536 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TSPOP30536 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TSPOP30536 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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