Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms