Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms