Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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