Protein–RNA interactions for Protein: P24522

GADD45A, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45AP24522 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.8 ms