Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
PTPRGP23470 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRGP23470 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRGP23470 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRGP23470 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRGP23470 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRGP23470 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRGP23470 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRGP23470 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRGP23470 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRGP23470 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRGP23470 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRGP23470 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRGP23470 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRGP23470 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRGP23470 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRGP23470 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRGP23470 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRGP23470 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRGP23470 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRGP23470 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRGP23470 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRGP23470 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRGP23470 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRGP23470 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRGP23470 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
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