Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS6KB1P23443 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms