Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF3P20783 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF3P20783 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF3P20783 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF3P20783 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF3P20783 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF3P20783 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF3P20783 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF3P20783 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF3P20783 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF3P20783 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF3P20783 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF3P20783 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF3P20783 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF3P20783 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF3P20783 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF3P20783 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF3P20783 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF3P20783 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF3P20783 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF3P20783 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF3P20783 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF3P20783 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF3P20783 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF3P20783 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF3P20783 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF3P20783 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF3P20783 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF3P20783 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF3P20783 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF3P20783 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF3P20783 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF3P20783 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF3P20783 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF3P20783 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF3P20783 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF3P20783 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF3P20783 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF3P20783 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF3P20783 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NTF3P20783 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NTF3P20783 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NTF3P20783 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NTF3P20783 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NTF3P20783 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NTF3P20783 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NTF3P20783 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NTF3P20783 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NTF3P20783 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NTF3P20783 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NTF3P20783 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NTF3P20783 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NTF3P20783 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NTF3P20783 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NTF3P20783 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NTF3P20783 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NTF3P20783 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NTF3P20783 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NTF3P20783 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NTF3P20783 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NTF3P20783 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NTF3P20783 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NTF3P20783 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NTF3P20783 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NTF3P20783 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NTF3P20783 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NTF3P20783 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NTF3P20783 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NTF3P20783 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NTF3P20783 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NTF3P20783 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NTF3P20783 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NTF3P20783 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NTF3P20783 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NTF3P20783 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NTF3P20783 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NTF3P20783 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NTF3P20783 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NTF3P20783 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NTF3P20783 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NTF3P20783 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NTF3P20783 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NTF3P20783 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NTF3P20783 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NTF3P20783 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NTF3P20783 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NTF3P20783 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NTF3P20783 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NTF3P20783 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NTF3P20783 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NTF3P20783 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NTF3P20783 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NTF3P20783 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NTF3P20783 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NTF3P20783 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NTF3P20783 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NTF3P20783 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NTF3P20783 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NTF3P20783 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NTF3P20783 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms