Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms