Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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RAB5AP20339 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB5AP20339 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB5AP20339 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB5AP20339 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB5AP20339 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB5AP20339 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB5AP20339 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB5AP20339 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB5AP20339 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB5AP20339 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB5AP20339 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB5AP20339 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB5AP20339 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB5AP20339 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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RAB5AP20339 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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RAB5AP20339 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB5AP20339 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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RAB5AP20339 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB5AP20339 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
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RAB5AP20339 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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RAB5AP20339 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB5AP20339 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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RAB5AP20339 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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RAB5AP20339 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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RAB5AP20339 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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