Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms