Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms