Protein–RNA interactions for Protein: P17480

UBTF, Nucleolar transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTFP17480 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBTFP17480 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBTFP17480 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBTFP17480 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBTFP17480 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBTFP17480 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBTFP17480 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBTFP17480 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBTFP17480 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBTFP17480 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBTFP17480 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBTFP17480 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBTFP17480 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBTFP17480 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBTFP17480 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBTFP17480 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
UBTFP17480 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBTFP17480 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBTFP17480 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBTFP17480 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
UBTFP17480 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UBTFP17480 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
UBTFP17480 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UBTFP17480 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UBTFP17480 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC27.57■■■□□ 2
UBTFP17480 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UBTFP17480 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UBTFP17480 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UBTFP17480 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
UBTFP17480 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
UBTFP17480 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
UBTFP17480 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
UBTFP17480 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
UBTFP17480 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UBTFP17480 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UBTFP17480 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UBTFP17480 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UBTFP17480 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UBTFP17480 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
UBTFP17480 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UBTFP17480 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UBTFP17480 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UBTFP17480 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UBTFP17480 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
UBTFP17480 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
UBTFP17480 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UBTFP17480 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UBTFP17480 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UBTFP17480 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UBTFP17480 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UBTFP17480 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UBTFP17480 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UBTFP17480 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UBTFP17480 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
UBTFP17480 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC27.56■■■□□ 2
UBTFP17480 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UBTFP17480 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
UBTFP17480 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
UBTFP17480 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
UBTFP17480 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
UBTFP17480 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
UBTFP17480 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
UBTFP17480 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
UBTFP17480 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UBTFP17480 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
UBTFP17480 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
UBTFP17480 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UBTFP17480 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
UBTFP17480 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UBTFP17480 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
UBTFP17480 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
UBTFP17480 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UBTFP17480 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UBTFP17480 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UBTFP17480 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UBTFP17480 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UBTFP17480 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
UBTFP17480 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
UBTFP17480 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
UBTFP17480 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UBTFP17480 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UBTFP17480 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UBTFP17480 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
UBTFP17480 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
UBTFP17480 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
UBTFP17480 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
UBTFP17480 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
UBTFP17480 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
UBTFP17480 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
UBTFP17480 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
UBTFP17480 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
UBTFP17480 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC27.54■■■□□ 2
UBTFP17480 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
UBTFP17480 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
UBTFP17480 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
UBTFP17480 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC27.54■■■□□ 2
UBTFP17480 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
UBTFP17480 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
UBTFP17480 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
UBTFP17480 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms